万方本科查重费用与论文重复率之间存在一定的关系。一般来说，查重费用较高的机构往往会提供更为严格的查重服务，这可能会导致论文重复率相对较低。因为高昂的查重费用意味着机构会投入更多的人力和技术资源来确保查重的准确性和全面性，从而降低论文重复率。然而，并非所有情况都是如此，有些机构可能收取高额查重费用却并未提供有效的查重服务，导致论文重复率仍然较高。

另外，万方本科查重费用与论文重复率的关系还受到其他因素的影响，如机构的信誉、查重算法的准确性、论文原创性要求等。因此，在选择万方本科查重服务时，除了关注费用因素外，还应该综合考虑以上各方面因素，以确保获得高质量的查重服务并降低论文重复率。同时，作者本身也应该注重论文的原创性和质量，避免出现过高的重复率，以提升论文的学术水平和影响力。